Sammlung der Entscheidungen des Schweizerischen Bundesgerichts
Collection des arrêts du Tribunal fédéral suisse
Raccolta delle decisioni del Tribunale federale svizzero

II. Öffentlich-rechtliche Abteilung, Beschwerde in öffentlich-rechtlichen Angelegenheiten 2C.342/2017
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Bundesgericht 
Tribunal fédéral 
Tribunale federale 
Tribunal federal 
 
                [displayimage]  
 
 
2C_342/2017  
 
 
Arrêt du 12 avril 2018  
 
IIe Cour de droit public  
 
Composition 
MM. les Juges fédéraux Seiler, Président, 
Donzallaz et Haag. 
Greffière : Mme Jolidon. 
 
Participants à la procédure 
Administration fiscale cantonale du canton de Genève, 
recourante, 
 
contre  
 
X.________ SA, 
représentée par Me Jean-Jacques Martin, avocat, 
intimée. 
 
Objet 
Impôt fédéral direct, impôts cantonal et communal 2003 à 2005, 2007 et 2009;
distribution dissimulée de bénéfice, 
 
recours contre l'arrêt de la Cour de justice de la République et canton de
Genève, Chambre administrative, 4ème section, du 21 février 2017 (A/2474/
2014-ICCIFD). 
 
 
Faits :  
 
A.  
 
A.a. X.________ SA, sise à Y.________ (GE), a pour but l'exploitation d'une
sablière, le transport et la vente de sable et de gravier, ainsi que toutes
opérations s'y rattachant. A.A.________, domicilié à Z.________, en est
l'actionnaire unique et l'administrateur unique avec signature individuelle.  
 
A.A.________ est également administrateur unique de la société A.A.________ SA,
devenue en novembre 2016 B.________ SA qui a pour but l'exploitation d'une
entreprise de transport de béton et autres matériaux, ainsi que l'exploitation
de garages. Il détient également l'entier du capital-actions de cette société. 
 
A.A.________ exploite en outre la raison individuelle "A.A.________", qui est
une entreprise de transports de matériaux par camions et qui possède un garage
avec atelier de réparation. Pour sa part, A.C.________, fils de A.A.________,
gère l'entreprise individuelle inscrite depuis le 12 décembre 2000 au registre
du commerce sous la raison sociale "A.C.________" qui a pour but le transport
et la location de véhicules, l'exploitation de garages, ainsi que le commerce
et la représentation de matériaux de construction. 
 
Le 25 novembre 2011, l'Administration fiscale cantonale de la République et
canton de Genève (ci-après: l'Administration fiscale cantonale) a informé
X.________ SA de l'ouverture d'une procédure en rappel et soustraction de
l'impôt fédéral direct (ci-après: IFD), ainsi que des impôts cantonal et
communal (ci-après: ICC) pour les années 2001 à 2010: la société semblait avoir
accordé des prestations appréciables en argent à son actionnaire et aux proches
de celui-ci par le biais de la location de véhicules appartenant à ceux-ci pour
des montants surfaits. A la demande du fisc, A.A.________ et A.C.________ lui
ont chacun transmis différentes pièces, dont des tableaux indiquant les
véhicules et engins loués à B.________ SA, ainsi qu'à X.________ SA. 
 
Le 29 novembre 2012, l'Administration fiscale cantonale a notifié à X.________
SA des décisions de rappel d'impôts pour l'IFD que l'ICC des années 2003 à
2005, 2007 et 2009, ainsi que les amendes y relatives. Le fisc a déterminé le
prix de la location, en se fondant sur la valeur d'achat des biens communiquée
par l'intimée: le 
montant de la location ne devait pas excéder ce qui serait facturé par une
société de leasing, à savoir des annuités constituées du remboursement du
crédit et des intérêts sur la valeur résiduelle des biens, telles qu'elles
auraient été chargées pour chaque véhicule et benne loués par la société, et ce
pour des durées de respectivement cinq et quatre ans pour les véhicules et les
bennes.  
 
La distribution dissimulée de bénéfice ainsi fixée se montait au total à
499'806 fr. Les amendes ICC et IFD étaient fixées à la moitié du montant de
l'impôt soustrait. Par décisions sur réclamation du 23 juillet 2014,
l'Administration fiscale cantonale a confirmé les reprises et les amendes en
cause. 
 
A.b. Le 18 décembre 2015, le Tribunal administratif de première instance de la
République et canton de Genève (ci-après: le Tribunal administratif de première
instance) a partiellement admis le recours de X.________ SA et annulé les
décisions sur réclamation du 23 juillet 2014: les reprises et les amendes
étaient justifiées dans leur principe, cependant l'Administration fiscale
cantonale avait calculé le montant des locations comme s'il s'agissait d'un
leasing, en prenant en compte l'amortissement des actifs et un intérêt aux taux
définis par les lettres-circulaires en la matière; il convenait plutôt de
calculer le coût d'une "vraie location" dans laquelle les charges sont assumées
par le locataire, en tenant notamment compte des risques et fonctionnalités
assumés par chacune des parties; ce coût devait être pris en considération
pendant toute la durée de la location et donc également après les quatre ou
cinq ans d'amortissement; en effet, un camion conserve une valeur même une fois
amorti et l'autorité fiscale ne pouvait partir du principe que le contribuable
qui loue un engin depuis cinq ans ne doit plus déduire des loyers pour
celui-ci, au motif qu'il aurait dû l'acheter. Les montants des reprises et des
amendes devaient être recalculés par l'autorité de taxation en se basant sur
des montants de loyers admissibles pour l'usage des actifs en cause, sans
limiter l'admission des locations à la période nécessaire à l'amortissement de
l'engin loué.  
 
B.   
X.________ SA et l'Administration fiscale cantonale ont interjeté recours à
l'encontre de ce jugement auprès de la Cour de justice de la République et
canton de Genève (ci-après: la Cour de justice) qui les a rejetés, par arrêt du
21 février 2017. En ce qui concernait les reprises, seules encore en cause
devant le Tribunal fédéral, elle a jugé qu'il existait bel et bien une
prestation appréciable en argent et a confirmé le raisonnement développé à ce
propos dans le jugement attaqué. Quant aux montants qui constituaient cette
prestation, la Cour de justice a estimé que la solution retenue par le fisc ne
prenait en compte aucun prix de location pour la période de mise à disposition
des véhicules après cinq ans, ni leur remplacement par des véhicules neufs aux
conditions du leasing, ce qui ne correspondait pas à l'échange tel qu'il avait
été réalisé, ni aux prix de pleine concurrence pour un échange similaire; les
corrections qui devaient être apportées par l'autorité de taxation aux montants
déclarés par la contribuable, s'agissant de la location des véhicules et
engins, devaient donc se fonder d'une part sur le prix de location usuel,
déduction faite des charges prises en compte par la contribuable, et d'autre
part sur la durée de location des véhicules dépassant les années
d'amortissement de leur valeur initiale. 
 
C.   
Agissant par la voie du recours en matière de droit public, l'Administration
fiscale cantonale demande au Tribunal fédéral, sous suite de frais, d'annuler
l'arrêt du 21 février 2017 de la Cour de justice et de confirmer les décisions
sur réclamation du 23 juillet 2014. 
 
X.________ SA conclut à l'irrecevabilité du recours, subsidiairement à son
rejet, sous suite de dépens. L'Administration fédérale des contributions
conclut à l'admission du recours et la confirmation des décisions sur
réclamation du 23 juillet 2014. La Cour de justice s'en rapporte à justice
quant à la recevabilité du recours et persiste dans les considérants et le
dispositif de son arrêt. 
 
Dans leurs dernières observations, l'Administration fiscale cantonale et
X.________ SA ont persisté dans leurs conclusions. 
 
 
Considérant en droit :  
 
1.  
 
1.1. La voie du recours en matière de droit public est ouverte (art. 82 let. a
LTF); cette voie de droit est confirmée par l'art. 146 de la loi fédérale du 14
décembre 1990 sur l'impôt fédéral direct (LIFD; RS 642.11) et 73 al. 1 de la
loi fédérale du 14 décembre 1990 sur l'harmonisation des impôts directs des
cantons et des communes (LHID; RS 642.14), la détermination du bénéfice
imposable étant une matière harmonisée aux art. 24 ss LHID.  
 
1.2. Dans son jugement du 18 décembre 2015, le Tribunal administratif de
première instance avait partiellement admis le recours de l'intimée, annulé les
décisions sur réclamations du 23 juillet 2014 et renvoyé la cause à l'autorité
de taxation qui devait calculer les reprises de façon différente. Bien que le
dispositif de l'arrêt du 21 février 2017 de la Cour de justice ne mentionne que
le rejet des recours des deux parties, dans les considérants de son arrêt,
cette autorité a expliqué le mode de calcul que l'autorité de taxation devait
appliquer pour les nouvelles taxations, afin de fixer les reprises à effectuer,
et a jugé que le "raisonnement appliqué par le Tribunal administratif de
première instance" devait être confirmé. L'arrêt de la Cour de justice du 21
février 2017, qui se substitue à celui du 18 décembre 2015 du Tribunal
administratif de première instance compte tenu de l'effet dévolutif complet du
recours auprès de ladite cour (arrêt 2C_841/2016 du 25 août 2017 consid. 1.4),
constitue ainsi un arrêt de renvoi, puisqu'à sa suite l'autorité de taxation
doit à nouveau procéder au calcul des reprises à effectuer. Il ne s'agit donc
pas d'une décision finale au sens de l'art. 90 LTF, mais d'une décision
incidente.  
 
En vertu de l'art. 93 al. 1 LTF et sous réserve d'exceptions non réalisées en
l'espèce (cf. art. 92 LTF), les décisions incidentes ne peuvent faire l'objet
d'un recours au Tribunal fédéral que si elles peuvent causer un préjudice
irréparable (let. a) ou si l'admission du recours peut conduire immédiatement à
une décision finale qui permet d'éviter une procédure probatoire longue et
coûteuse (let. b). Selon la jurisprudence, une autorité qui serait tenue, à la
suite d'une décision de renvoi, de rendre une nouvelle décision qui, de son
point de vue, serait contraire au droit, sans pouvoir par la suite la remettre
en cause devant l'instance supérieure, est réputée subir un préjudice
irréparable au sens de l'art. 93 al. 1 let. a LTF (ATF 138 V 106 consid. 1.2 p.
109). 
 
En l'espèce, l'arrêt attaqué invite l'Administration fiscale cantonale, de
manière contraignante, à rendre une nouvelle décision en calculant les reprises
à effectuer selon une méthode déterminée qui n'est pas celle prônée par
l'autorité de taxation, décision qu'elle ne pourrait plus attaquer par la suite
(ATF 134 II 124 consid. 1.3 p. 128; 133 V 477 consid. 5.2 p. 483). Par
conséquent, le recours de l'Administration fiscale cantonale est recevable sous
l'angle de l'art. 93 al. 1 let. a LTF. 
 
1.3. Pour le surplus, le recours a été déposé en temps utile (art. 100 al. 1
LTF) et dans les formes requises (art. 42 LTF) par l'Administration fiscale
cantonale, qui a qualité pour recourir (art. 146 LIFD, 73 al. 2 LHID et 89 al.
1 LTF), contre une décision d'une autorité judiciaire supérieure ayant statué
en dernière instance cantonale (art. 86 al. 1 let. d LTF).  
 
I. Impôt fédéral direct  
 
2.   
Il est acquis que l'intimée a procédé à une distribution dissimulée de bénéfice
en payant des montants surfaits pour la location de véhicules de chantier
appartenant à l'actionnaire, A.A.________, et à son fils, A.C.________. Le
litige porte sur la façon dont les reprises doivent être calculées. 
 
3.   
L'autorité précédente a exposé le droit applicable et la jurisprudence relative
à la procédure de taxation (art. 124 ss LIFD), à la notion de bénéfice et de
distribution dissimulée de bénéfice, y compris le principe de pleine
concurrence ("dealing at arm's length"; art. 58 al. 1 let. a et let. b LIFD;
ATF 140 II 88 consid. 4.1 p. 92 s.; 138 II 545 consid. 3.2 p. 549; 119 Ib 116
consid. 2 p. 119), de façon correcte et détaillée, de sorte qu'il y est
renvoyé. 
 
4.   
Selon la recourante, la Cour de justice a indûment renversé le fardeau de la
preuve. Cette autorité a reconnu l'existence de prestations appréciables en
argent et aurait donc ainsi considéré que la recourante avait amené
suffisamment d'indices démontrant que le montant des locations des machines de
chantier et des camions étaient surévalués. Cette constatation aurait dû
renverser le fardeau de la preuve: il appartenait, dès lors, à l'intimée
d'apporter la preuve que les charges comptabilisées étaient conformes à l'usage
commercial. Or, la Cour de justice a estimé que les pièces fournies par
l'intimée n'étaient pas probantes car les prix retenus étaient trop élevés en
ce qu'ils incluaient dans le prix de location des éléments qui ne pouvaient lui
être facturés, comme par exemple l'entretien; en outre, ils étaient fondés sur
des prix de location pratiqués au mois, alors que l'intimée louait les biens
sur une durée illimitée, et ces prix étaient ceux d'une société tierce valables
pour 2010, alors que les reprises concernaient aussi d'autres années. En
écartant la méthode retenue par la recourante, alors que l'intimée n'avait pas
réussi à démontrer que les charges qu'elle avait comptabilisées étaient
justifiées commercialement, la Cour de justice aurait violé le principe de
répartition du fardeau de la preuve. 
 
4.1. Il appartient à l'autorité de taxation d'établir les faits qui fondent la
créance d'impôt (ATF 105 Ib 382) ou qui l'augmentent, alors que le contribuable
doit alléguer et prouver les faits qui suppriment ou réduisent cette créance (
ATF 140 II 248 consid. 3.5 p. 252; 133 II 153 consid. 4.3 p. 158; 92 I 253
consid. 2 p. 256/257). Dans le cadre d'une procédure de rappel d'impôt et
d'amende, cette autorité doit prouver que l'imposition est incomplète (RDAF
1993 32 consid. 2b p. 35, 2A.299/1989).  
 
Dans le domaine des prestations appréciables en argent, les autorités fiscales
doivent apporter la preuve que la société a fourni une prestation et qu'elle
n'a pas obtenu de contre-prestation ou une contre-prestation insuffisante. Si
les preuves recueillies par l'autorité fiscale fournissent suffisamment
d'indices révélant l'existence d'une telle disproportion, il appartient alors
au contribuable d'établir l'exactitude de ses allégations contraires (ATF 138
II 57 consid. 7.1 p. 66; 133 II 153 consid. 4.3 p. 158). Par ailleurs, une fois
qu'un fait est tenu pour établi, la question du fardeau de la preuve ne se pose
plus (ATF 137 III 226 consid. 4.3 p. 235; 128 III 22 consid. 2d p. 25). 
 
4.2. En l'espèce, l'autorité de taxation, comme il le lui incombait, a prouvé
qu'il y avait eu des distributions dissimulées de bénéfice et la Cour de
justice a conclu que les prix pratiqués pour la location des véhicules
appartenant à l'actionnaire et à son fils ne répondait pas à l'usage
commercial, ce que l'intimée ne conteste plus. Cet élément établi, il
s'agissait de fixer le montant des reprises à opérer pour le rappel d'impôt et,
par conséquent, de déterminer la méthode à appliquer pour fixer ces reprises.
Or, dans un tel cas, la détermination de la valeur vénale de biens ou de
services n'est pas qu'une pure question de fait. Celle-ci doit être conforme
aux principes du droit fédéral et respecter le principe de pleine concurrence
("dealing at arm's length"), la loi ne prévoyant pas de règles en la matière
(sous exception de l'art. 58 al. 3 LIFD, non pertinent ici). D'ailleurs, le
Tribunal fédéral revoit librement si la méthode choisie respecte le principe de
pleine concurrence (Archives 83 p. 611, 2C_1082/2013 consid. 5.5). L'autorité
précédente pouvait donc, tout en admettant qu'il y avait eu distribution
dissimulée de bénéfice, ne pas accepter la façon dont l'autorité de taxation
avait calculé les reprises quant à la surfacturation des locations de
véhicules; ce faisant, elle n'a en aucune façon violé la répartition du fardeau
de la preuve, puisqu'est en cause l'application du droit. Partant, le grief de
la recourante tombe à faux.  
 
 
5.   
La constatation susmentionnée, à savoir que la détermination de la méthode à
appliquer, afin de fixer le montant des reprises, doit être conforme aux
principes du droit fédéral, aboutit également à rejeter le grief relatif à
l'appréciation arbitraire des preuves, puisqu'il ne s'agit pas d'appréciation
des preuves. En contestant le mode de calcul préconisé par l'autorité
inférieure pour la location des véhicules de l'actionnaire et de son fils par
la société intimée pendant les années 2003 à 2005, 2007 et 2009, la recourante
s'en prend à l'application du droit fédéral, ce qui sera examiné ci-dessous. 
 
6.   
L'objet du litige porte sur la méthode à appliquer afin de déterminer de façon
objective et concrète le montant de la location des véhicules en cause qui
aurait été convenu entre personnes indépendantes ("Drittvergleich"),
c'est-à-dire en fonction du principe de pleine concurrence (cf. supra consid.
3). 
 
6.1. En l'espèce, l'intimée a loué, de 2003 à 2005 et en 2007 et 2009,
différents véhicules appartenant à son actionnaire, A.A.________, et à son
fils, A.C.________. Elle les louait depuis leur acquisition par les raisons
individuelles de l'actionnaire et de son fils jusqu'à leur revente ou leur mise
au rebut; des loyers étaient ainsi versés indéfiniment pour des biens amortis
dont la société n'acquerrait jamais la propriété. L'intimée prenait, en outre,
à sa charge la totalité des coûts relatifs à ces actifs (immatriculation,
entretien, réparation, etc.); elle supportait et gérait les risques
entrepreneuriaux, alors que les raisons individuelles de l'actionnaire et de
son fils ne supportaient que les risques liés à l'immobilisation des fonds
ayant permis l'achat des actifs. Les montants des locations, pour les périodes
concernées, s'élevaient environ au triple de la valeur d'acquisition des
actifs. Il s'agit donc de déterminer les reprises à opérer.  
 
6.2. La Cour de justice a estimé que le fisc devait procéder à de nouveaux
calculs, se fondant non pas sur le modèle du leasing, mais en prenant en
compte, d'une part, des prix de location usuels, déduction faite des charges
supportées par l'intimée et, d'autre part, "la durée de location des véhicules
dépassant les années d'amortissement de leur valeur initiale".  
 
Il apparaît d'emblée qu'il n'est pas judicieux de se baser sur les tarifs de
location usuels, même en les corrigeant en en déduisant les charges supportées
par l'intimée (ce qui, au demeurant, serait impossible à réaliser, selon la
recourante, car la comptabilité de l'intimée ne serait pas assez détaillée pour
déterminer ces montants), comme le suggère la Cour de justice. En effet, les
tarifs dont il est question énumèrent des locations à la journée, à la semaine
ou au mois. Ceux-ci ne sauraient ainsi représenter le montant qui pourrait être
demandé pour un objet loué sur toute la durée de sa vie économique. Les tarifs
de location sont dégressifs: une location sur le long terme induit une
diminution du tarif. Comme le souligne la recourante, ce point est démontré par
l'offre de location de la société D.________ SA pour un camion à quatre essieux
fournie par la recourante: le tarif est de 522 fr. pour la journée, de 1'810
fr. à la semaine et de 6'778 fr. pour le mois; le prix journalier multiplié par
trente (15'660 fr.) ou le prix hebdomadaire multiplié par quatre (7'240 fr.)
donne des résultats plus élevés que les 6'778 fr. indiqués comme location
mensuelle, contrairement à ce qu'avance l'intimée. Ainsi, on ne peut pas
prendre un tarif au mois et le multiplier par douze, et ce sur de nombreuses
années, même avec des aménagements à apporter ensuite au résultat obtenu
(déduction des charges prises en compte par l'intimée, etc.), comme le
suggèrent les juges précédents. En outre, durant la procédure, aucune partie
n'a démontré qu'il existait des tarifs de location pour des biens loués sur une
durée illimitée 
 
Pour sa part, la recourante explique que le prix usuel d'une location de
véhicules comporte les éléments suivants: 
 
- amortissement du véhicule, 
- coût du financement, 
- entretien et réparation, 
- assurances, taxes et immatriculation, 
- marge (visant à couvrir les charges fixes et à réaliser un bénéfice
approprié). 
 
La solution des juges précédents, consistant à retrancher de ce prix
hypothétique, les charges assumées par la recourante (frais d'entretien, de
réparation, d'assurances, de taxes et d'immatriculation) aboutit à retenir les
amortissements, les coûts de financements et la marge. Comme susmentionné, la
marge comprise dans le prix usuel d'une location décroit avec la durée de
location (plus la location est longue, plus le prix de location est favorable
et plus la marge est réduite). Or, dans le présent cas, les biens sont loués
pour la totalité de leur vie économique. Il faut donc suivre la recourante en
tant qu'elle argumente que le prix tel qu'il devrait être pris en compte se
rapproche d'un leasing qui calcule des marges tenant précisément compte d'une
location couvrant toute la vie économique du bien. L'intimée se trompe
lorsqu'elle prétend que cette façon de calculer les reprises lui impose un
modèle économique (le leasing) en lieu et place de celui qu'elle a choisi, à
savoir la location. Ce modèle est simplement celui dont les tarifs sont les
plus adéquats pour déterminer les reprises à effectuer compte tenu de la façon
dont a procédé l'intimée, étant souligné que le leasing peut aussi être un
leasing de pure location (sans option d'achat). En outre, comme le note la
recourante, le leasing intègre un montant pour le remplacement du bien loué
voire son acquisition: s'il ne devait pas être tenu compte de ces éléments, les
montants pris en compte à titre de location seraient inférieurs à ceux calculés
par la recourante et, partant, les reprises supérieures à celles déterminées.
Il est encore relevé que les taux d'intérêts retenus à bon droit par la
recourante pour le leasing sont basés sur les taux définis dans ses
lettres-circulaires pour les crédits commerciaux consentis aux actionnaires à
leur société et sont calculés sur la valeur résiduelle des biens à la fin de
l'année. 
 
La recourante a fondé ses calculs sur un remboursement annuel de la valeur des
camions s'étalant sur cinq ans. La Cour de justice et l'intimée estiment que
si, comptablement, les engins de chantier peuvent être amortis sur une période
de cinq ans, leur durée de vie économique est plus longue; il faudrait ainsi
prendre en compte des locations allant au-delà des cinq ans admis. A cet égard,
il est relevé, premièrement, qu'il ressort du dossier que les raisons
individuelles détentrices des engins les ont amortis sur cinq ans (art. 105 al.
2 LTF). Secondement, il est établi que si la durée des amortissements devait
s'étaler sur plus de cinq ans, les amortissements pour les années litigieuses
seraient inférieurs à ceux retenus pour cinq ans et, partant, les reprises pour
lesdites années supérieures à celles effectuées. Ainsi, compte tenu de
l'interdiction de la reformatio in pejus, il n'est pas nécessaire d'examiner
s'il convenait de prendre en compte une déduction pour la mise à disposition
des biens après cinq ans. 
 
6.3. Le recours est donc admis en tant qu'il concerne l'IFD des périodes
fiscales 2003 à 2005, 2007 et 2009.  
 
II. Impôts cantonal et communal  
 
7.   
Conformément à l'art. 24 al. 1 LHID, l'art. 12 de la loi genevoise du 23
septembre 1994 sur l'imposition des personnes morales (LIPM/GE; D 3 15), dans
sa teneur en vigueur jusqu'au 29 mars 2016 et applicable à la présente affaire
qui se rapporte aux périodes fiscales 2003 à 2005, 2007 et 2009, prévoit que le
bénéfice net tel qu'il résulte du compte de profits et pertes, ainsi les
allocations volontaires à des tiers et les prestations de toute nature fournies
gratuitement à des tiers ou à des actionnaires de la société sont considérés
comme bénéfice net imposable. Il pose le même principe que l'art. 58 LIFD en
matière de distribution dissimulée de bénéfice (arrêt 2C_209/2013 du 16 janvier
2014 consid. 4) qui comprend le principe de pleine concurrence. Dès lors, les
considérations développées ci-dessus pour l'impôt fédéral direct quant aux
reprises à effectuer pour les périodes fiscales 2003 à 2005, 2007 et 2009
s'appliquent mutatis mutandis à l'impôt sur le bénéfice cantonal et communal
desdites périodes. 
 
En conséquence, le recours est également est admis en tant qu'il concerne les
ICC de ces périodes. 
 
8.   
Le recours devant être admis, point n'est besoin d'examiner le grief relatif à
la violation du droit d'être entendu soulevé par la recourante. 
 
9.   
Compte tenu de ce qui précède, le recours est admis tant en ce qu'il a trait à
l'impôt fédéral direct qu'aux impôts cantonal et communal des périodes fiscales
2003 à 2005, 2007 et 2009. L'arrêt attaqué est annulé et les décisions sur
réclamation du 23 juillet 2014 de l'Administration fiscale cantonale portant
sur lesdits impôts des périodes fiscales en cause sont rétablies. 
 
Les frais judiciaires, arrêtés à 5'000 fr., sont mis à la charge de l'intimée (
art. 65 et 66 al. 1 LTF). L'administration cantonale n'a pas droit à des dépens
(art. 68 al. 3 LTF). La cause sera en outre renvoyée à la Cour de justice afin
qu'elle fixe à nouveau les frais et dépens de la procédure cantonale (cf. art.
67 et 68 al. 5 LTF). 
 
 
 Par ces motifs, le Tribunal fédéral prononce :  
 
1.   
Le recours est admis en tant qu'il concerne l'impôt fédéral direct pour les
périodes fiscales 2003 à 2005, 2007 et 2009. L'arrêt du 21 février 2017 de la
Cour de justice est annulé et les décisions sur réclamation du 23 juillet 2014
de l'Administration cantonale portant sur cet impôt des périodes fiscales en
cause sont rétablies. 
 
2.   
Le recours est admis en tant qu'il concerne les impôts cantonaux et communaux
pour les périodes fiscales 2003 à 2005, 2007 et 2009. L'arrêt du 21 février
2017 de la Cour de justice est annulé et les décisions sur réclamation du 23
juillet 2014 de l'Administration fiscale cantonale portant sur lesdits impôts
des périodes fiscales en cause sont rétablies. 
 
3.   
Les frais judiciaires, arrêtés à 5'000 fr., sont mis à la charge de l'intimée. 
 
4.   
Il n'est pas alloué de dépens. 
 
5.   
La cause est renvoyée à la Cour de justice afin qu'elle fixe à nouveau les
frais et dépens de la procédure cantonale. 
 
6.   
Le présent arrêt est communiqué à la recourante, au mandataire de l'intimée, à
la Cour de justice de la République et canton de Genève, Chambre
administrative, 4ème section, et à l'Administration fédérale des
contributions. 
 
 
Lausanne, le 12 avril 2018 
Au nom de la IIe Cour de droit public 
du Tribunal fédéral suisse 
 
Le Président : Seiler 
 
La Greffière : Jolidon 

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